Bên cạnh chương trình giảng dạy toàn diện, thì cơ sở vật chất cũng đóng vai trò quan trọng và là một trong những yếu tố mang lại tất cả những gì học sinh cần để phát triển trọn vẹn tiềm năng của mình trên hành trình học tập tại NLCS HCMC.

Tọa lạc tại trung tâm thành phố, khuôn viên của NLCS HCMC được thiết kế cẩn trọng, đáp ứng mục đích giáo dục, mở ra những trải nghiệm tốt nhất cho học sinh, mang cảm giác gắn kết gần gũi với cộng đồng. Các phòng học lớn, ngập tràn ánh sáng sử dụng công nghệ tiên tiến nhất nhằm nâng cao chất lượng học tập.

Bên cạnh các lớp học, trường thiết kế những không gian sáng tạo dành riêng cho nghiên cứu khoa học, CNTT, nghệ thuật, âm nhạc và kịch. Học sinh có thể vui chơi, học tập và khám phá vô hạn không gian mở ngoài trời. Học sinh tại NLCS HCMC có toàn quyền sự dụng các cơ sở vật chất tại Học viện Thể thao Quốc tế Việt Nam trong suốt thời gian học tập.

Được thiết kế đặc biệt để hỗ trợ chương trình giảng dạy NLCS, quốc tế và Việt Nam, nhà trường cung cấp điều kiện tốt nhất để có thể đồng thời triển khai hai chương trình quốc tế và bản địa. Không gian tích hợp, liên môn là một trong những đặc điểm chính trong phương pháp tiếp cận học tập của nhà trường.